Billie Biscotti est frustrée parce que l’équipage lui répète qu’elle est trop petite pour faire certaines choses par elle-même. Un jour, elle se retrouve seule à bord du Calypso pendant une de leur mission, mais les choses ne se déroulent pas comme prévu. C’est finalement elle qui va devoir sauver tout le monde!

En voulant renforcer l’esprit d’équipe au sein de l’Unité Cyclone, Plink et Krill se font avaler par un Kraken. Lettie fait tout ce qu’elle peut pour les sauver, mais Léo n’arrête pas de la déconcentrer avec sa guitare. Alors qu’ils sont dans une situation impossible, Léo espère que sa musique pourra les sauver...

L’équipage du Calypso a toujours compté sur le travail d’équipe pour exceller, mais quand Mira Cristalline se met à lui voler des missions et les réussit avant même qu’il n’arrive sur les lieux, Lettie décide de tenter sa chance en solo.

Léo présente à l’équipage sa dernière invention, Robomousse, un robot concierge. À la dernière minute, ils apprennent que le vaisseau est sur le point d’être inspecté. L’équipage ne fait pas d’efforts et Lettie finit par se fâcher. Elle ordonne à tout le monde de nettoyer. Exclu de l’effort collectif, Léo va acheter une jolie plante qui finira par faire plus de mal que de bien.

Un volcan entre en éruption, et l’équipage doit sauver une méduse orpheline du danger. Comme l’équipage s’attache immédiatement à cet animal abandonné, Billie Biscotti se sent délaissée. L’équipage du Calypso finira par lui enseigner une leçon sur l’importance de la famille.

Alors que l’équipage du Calypso combat une araignée de mer géante qui terrorise la population de Glaciale-ville, Léo et Freddie mettent involontairement l’équipage en danger. Phil devra surmonter sa plus grande peur afin de sauver ses camarades.

Alors que Lettie fait tout pour que les choses se passent bien pendant la mission, l’équipage fait une étrange découverte : il se rend compte qu’il s’agit de bien plus qu’une simple créature toute mignonne.

À cause d’un malentendu, le Roi Globulus et ses gardes prennent en otage l’ensemble des vaisseaux de l’Unité cyclone. De son côté, Billie Biscotti apprend qu’elle ne doit pas prendre les choses qui ne lui appartiennent pas. Lettie et Léo doivent rendre sans se faire prendre ce que Billie Biscotti a pris sans permission.

Lettie découvre que si le Calypso est trop lourd, c’est parce que Léo a gardé tous ses précieux souvenirs. Ce dernier essaie de trouver un moyen de se départir de ses objets et découvre qu’il peut aider les autres en même temps.

L’équipage du Calypso n’est pas content : le cochon de mer de Léo fait des dégâts et sème le chaos à bord du vaisseau. Ce petit animal se sent bien loin des siens, mais Léo est trop attaché à lui pour le ramener dans son milieu naturel, c’est-à-dire dans la zone de minuit.

C’est la course du corail et c’est la première fois que le Calypso y participe! Lettie n’est pas du genre à tricher, contrairement aux autres, mais elle veut désespérément faire ses preuves. Laissera-t-elle son désir de gagner l’emporter sur ses valeurs ?

Les membres de l’équipage du Calypso reçoivent un gâteau comme récompense pour avoir accompli une mission, mais le dessert disparaît! Chaque personne accuse l’autre, sans chercher à comprendre ce qui s’est réellement produit. Pendant ce temps, Billie Biscotti tente de les avertir d’un danger imminent, sans succès.

Freddie passe un moment difficile lorsque ses camarades décident de remplacer Ana-Lise par un nouveau système à la fine pointe de la technologie. L’ingénieur cherche alors quel rôle il pourrait jouer à bord du Calypso. L’équipage réalisera rapidement que le Zoomitron 500 000 n’a pas que des avantages…

Léo est ravi d’être invité à faire un stage au quartier général de l’Unité Cyclone. Il doit aider ceux et celles qui y travaillent en proposant des solutions originales à leurs problèmes. Lettie doute que la Léo-logique convienne aux équipes de l’amiral Krill. Est-ce que Léo saura s’adapter à ce nouvel environnement?

Le roi des hippocampes demande à Lettie et son équipage de veiller sur ses trésors pendant une fête. Billie Biscotti se retrouve nez à nez avec un voleur, mais ses camarades ne comprennent pas qu’elle a besoin de leur aide. Elle doit se faire confiance pour arriver à piéger ce méchant poisson toute seule.

Lorsque de dangereux geysers apparaissent au fond de l’océan, l’équipage du Calypso part en mission pour trouver la cause de ce phénomène. Billie Biscotti est contrariée parce que plus personne n’a le temps de jouer aux pirates avec elle. La petite quitte donc le vaisseau à la recherche de nouveaux camarades de jeux. Que lui arrivera-t-il?