McGarrett et Wo Fat parviennent à s’échapper de la prison à sécurité maximale. Après quoi, des hommes armés prennent d’assaut le QG de notre équipe de choc, risquant de dévoiler le lieu où sont cachés Kono et Adam à Hong Kong et forçant McGarrett à enfreindre la loi. Il ne peut compter que sur lui-même pour retrouver Catherine, qui a été enlevée.

Tandis qu’elle enquête sur un meurtre, l’équipe doit aider un membre des Texas Ranger à chercher sa fille disparue. De leur côté, Kono et Adam sont en mauvaise posture, car leur cachette a été trouvée.

Un objet très ancien qui a disparu est la clé pour résoudre un double homicide. L’équipe reçoit l’aide d’un adepte des théories du complot.

L’équipe enquête sur le meurtre d’un homme qui s’est invité à un mariage, et leur principale suspecte n’est autre que la mariée, qui a pris la fuite. De son côté, Danny prend une importante décision concernant sa relation avec Gabby.

Catherine a un nouveau travail, où elle est chargée de faire de la surveillance. Il n’y a rien de dangereux, du moins jusqu’à ce qu’une situation tourne mal. Parallèlement, Adam envisage de faire le sacrifice suprême pour sauver Kono.

C’est l’Halloween à Hawaï. Un homme déguisé en zombie est abattu, et l’équipe court contre la montre pour arrêter un fou furieux qui pratique des expériences sur des êtres humains.

Tandis que l’équipe enquête sur le meurtre d’un agent infiltré, Mary tombe malade et l’unité de choc se retrouve avec le bébé qu’elle vient d’adopter sur les bras.

Le gouverneur envoie McGarrett et Grover arrêter un jeune pirate informatique, et tous deux se retrouvent à collaborer pour sauvegarder la sécurité nationale.

L’équipe se penche sur le meurtre d’un agent des services secrets tandis que le président des États-Unis se trouve à Oahu pour célébrer l’Action de grâce. En prime, McGarrett reçoit la visite de sa tante Deb, qui arrive avec un terrible secret.

Un ancien combattant ayant vécu l’attaque de Pearl Harbor est victime d’une tentative d’assassinat. L’équipe va déterrer de très vieilles preuves pour enquêter sur un meurtre commis au sein des camps d’internement à Oahu pendant la Deuxième Guerre mondiale.

L’enquête sur un crime met la vie de Chin en danger, car l’auteur pourrait bien être un tueur en série. De leur côté, Danny et Grace tombent sur une mystérieuse boîte de casse-tête sur les côtes d’Oahu.

McGarrett aide Grover à chercher un de ses amis qui a disparu après avoir, apparemment, commis un meurtre. De son côté, Kono est toujours à la recherche d’Adam.

Les Affaires internes interrogent Chin sur le meurtre de son père, commis 15 ans plus tôt, et cherchent à savoir dans quelle mesure sa relation alors naissante avec Malia et sa famille a entravé l’enquête.

Un condamné s’évade et enlève McGarrett et Danny, car il veut que l’unité de choc prouve son innocence. De son côté, Danny a fort à faire avec Grace, qui en est venue aux poings à l’école.

L’équipe se penche sur le meurtre d’un agent immobilier dont le corps vient d’être retrouvé emmuré dans une propriété qu’il cherchait à vendre. Parallèlement, la mère de Danny arrive à Oahu et lui apprend une nouvelle qui le bouleverse.

L’équipe enquête sur un triple homicide lié à la chute d’un satellite chinois ultra secret. De son côté, Grover emmène la mère de Danny sur le terrain.

L’équipe veut connaître le fin mot d’une affaire sordide où un homme a été abattu dans la foulée de l’enlèvement de sa fille. Parallèlement, Danny tente de raccommoder ses parents, tandis que Jerry déchiffre un code qu’il a trouvé au fond du coffre à outils de McGarrett.

Chin se rend à une réunion d’anciens élèves pendant laquelle la fille d’un magnat de la noix de macadamia se fait assassiner à coups de talon aiguille : l’équipe se charge de l’affaire.

L’équipe se fait piéger par une fausse piste qui les conduit dans un immeuble désaffecté sur le point d’exploser. McGarrett et Danny sont coincés à l’intérieur.

Le meurtre d’un homme chargé de l’entretien des piscines conduit l’équipe à découvrir ce qui ressemble à une cellule terroriste formée d’étudiants radicalisés prêts à lancer une attaque sur le sol américain.

Il y a quelques années, Catherine a été sauvée par une famille afghane. Aujourd’hui, la vie de leur fils est menacée par les talibans. Catherine et McGarrett s’envolent pour l’Afghanistan.

La fille de Grover est enlevée par un vieil ennemi : il va devoir dérober 100 millions de dollars pour pouvoir la récupérer. Parallèlement, Wo Fat s’évade de prison et se dirige vers Oahu.