Les répercussions de la désastreuse présentation de Masters s’étendent bien au-delà de son renvoi de la maternité. Libby, qui s’inquiète pour leur nouveau-né, le pousse à chercher un autre emploi. Johnson, qui travaille toujours pour la Dre DePaul, doit faire face à des avances et à des sous-entendus à la suite de rumeurs voulant qu’elle soit la femme vue dans le film.

Masters prend ses nouvelles fonctions à l’hôpital Memorial grâce aux manigances de Betty, mais il apprend que son chef préfère engager une secrétaire de son choix plutôt que Johnson. Celle-ci, toujours isolée à la maternité, est déchirée entre son désir de pousser Masters à la réengager et celui de rester avec DePaul, dont la santé se détériore.

Masters aide une femme à accoucher d’un bébé qui présente des organes sexuels ambigus. Il exhorte les parents à ne pas intervenir chirurgicalement pour attribuer un sexe à l’enfant, que ce soit par peur ou par souci des convenances. Johnson et Masters se retrouvent en secret dans un hôtel, où ils sont distraits dans leur jeu de rôle sexuel par un combat de boxe, ce qui amène Johnson à déterrer des secrets sur l’enfance difficile de Masters.

Langham voit Masters et Johnson sortir d’une chambre d’hôtel après un rendez-vous nocturne. Il parle de ses soupçons à DePaul, ce qui cause des frictions entre les deux femmes et remet l’emploi de Johnson en question. Les efforts de Masters visant à faire engager Johnson comme assistante sont contrecarrés par le chef de l’hôpital, un homme entretenant une curiosité malsaine pour l’étude. Betty tente de cacher son infertilité à Gene.

Masters continue d’explorer de nouveaux territoires dans son étude à titre de seul médecin blanc dans un hôpital réservé aux Noirs, mais cela se fait au détriment de sa pratique de gynécologue. Le frère de Coral, Robert, s’en prend à Libby, à qui il reproche le traitement subi par sa sœur. Betty retrouve, pour sa part, un ancien amant, alors que Johnson s’efforce de rétablir les liens avec DePaul, qui vient d’apprendre sa relation en cours avec Masters.

Masters, qui s’est vu interdire par Hendricks le recrutement de personnes noires pour son étude, contacte un journaliste pour faire connaître son travail sous couvert de démystifier les stéréotypes sexuels associés aux Noirs. Johnson est forcée d’accepter la décision de DePaul qui choisit d'arrêter la chimiothérapie. Gene découvre la vérité sur la relation entre Betty et Helen. Libby renvoie Coral après avoir appris que celle-ci avait menti en présentant Robert comme son amant.

Après avoir découvert que Johnson continuait d'avoir des aventures avec d’autres hommes, Masters devient impuissant. Il cache ce fait à Johnson et met fin à leur collaboration scientifique sur la sexualité. Il tente de maintenir sa clinique à flot pendant trois ans en hypothéquant sa maison, en offrant des services médicaux à l’hôtel et, finalement, en acceptant de l’argent de sa mère.

Masters traite un couple en privé pour infertilité sans révéler sa relation avec eux. Johnson se rend compte que son travail avec Masters peut être utilisé pour aider les gens souffrants de dysfonction sexuelle, mais elle se retrouve rapidement dépassée lorsqu’elle essaie de traiter Barbara Sanderson toute seule. Libby est bouleversée après avoir assisté à un crime haineux qui est ensuite étouffé par la police.

Au cours d’une discussion sur leur passé commun autour de la table familiale, Masters est hérissé par les insinuations de Frank au sujet de ses démons et de ceux d’Estabrooks. Virginia continue de se faire passer pour une patiente afin d’obtenir les conseils d’un psychiatre. Betty et Masters tentent d’aider Lester à remédier à son impuissance en engageant une prostituée, ce qui le perturbe encore plus.

Johnson, qui a finalement appris les difficultés sexuelles de Masters, est encouragée par la perspective de trouver un remède. Lorsque Masters apprend qu’une étude concurrente a été lancée, il fait appel à un expert en relations publiques pour l’aider à protéger son travail avec Johnson.

Une équipe de télévision arrive à la clinique pour tourner un reportage sur les travaux de Masters et de Johnson sur les dysfonctions sexuelles. Masters considère que cette publicité est prématurée et qu’il n’a pas la présence physique nécessaire pour apparaître à l’écran, particulièrement à la suite des leçons apprises sur le pouvoir de la télévision à l’occasion des débats Nixon-Kennedy.

Après avoir regardé un prémontage du documentaire, Masters est perturbé par la façon dont son travail a été déformé. Johnson prend des mesures pour officialiser son arrangement de garde avec George, mais cela se retourne contre elle. Libby poursuit sa relation avec Robert, invoquant la distraction de Master pour se justifier.